Den fantastiske historien til Patagonia startet i Yosemite i 1957 med den ivrige fjellklatreren Yvon Chouinard, som på grunn av stor frustrasjon over dårlige bolter, hadde kjøpt et nedlagt smiverksted og begynt å lage sine egne. Etter flere år med suksess som leverandører av hardvare, flyttet fokuset seg gradvis til klær for fjellklatrere og et navneskifte til det merket vi kjenner i dag.
Spesielt populær ble den første polyesterfleecegenseren - Synchilla - da den ble introdusert på '70-tallet, og som i senere år har blitt laget utelukkende av resirkulerte materialer.
Patagonia produserer i dag flere typer turtøy, sekker og klær, og har etablert seg som en spesielt miljøbevisst og etisk merkevare. De fortsetter å ta dette engasjementet seriøst, og viser stadig at de er et handlekraftig merke som tar deres ansvar for miljøvern på alvor.